曾几何时神秘生物奇居子入侵太阳系致使人类流离失所只能乘坐行星般大小的巨型飞船希德尼娅流浪在茫茫宇宙中如是过了漫长的一千年而今希德尼娅的居民们已有一百年未曾遭遇奇居子不过他们从未放松警惕培养了一代又一代操纵人形兵器卫人的驾驶员某天居住在地下的青年谷风长道逢坂良太 配音迫于饥饿爬到地面偷米后被人抓住后在舰长大原沙耶香 配音的授意下成为卫人驾驶员第628期的训练生在这里他见到了有过一面之缘的善良女孩星白闲洲崎绫 配音友好的第三性人科户濑伊扎那丰崎爱生 配音以及高傲刚愎的岐神海苔夫樱井孝宏 配音等人未几少年们外出执行采集任务甚至却遭逢百年不见的奇居子沉寂已久的宇宙战争再度拉开帷幕…　　本片根据贰瓶勉的漫画原作改编