福娃之一的贝贝在梦中遇到激战的和平女神雅典娜与战神阿瑞斯　　战败的雅典娜身受重伤她告诉贝贝在时空隧道中的1896年有一个隐藏了巨大能量的木盒只有得到里面的能量才能恢复自己的盾牌和生命打败邪恶的阿瑞斯　　醒来之后在顾拜旦来信的提示下贝贝立下誓言要穿越时空回到1896年帮助女神取得木盒　　依照雅典娜的指示贝贝下海寻找能够穿越时空的东方时空老人必喜但却在深海峡谷中遇到了贪吃成性的小妖怪皮休他是龙之九子必喜的弟弟多年前因为想吃太阳而掉入大海目前正为自己永远饥饿的胃病而苦恼一听说隐藏巨大能量的木盒也十分积极地加入了贝贝的旅行　　在皮休的带领下贝贝找到了必喜必喜载着二人进入了时空隧道却在通过了二十一世纪大门之后不久中了阿瑞斯手下普噜噜的埋伏必喜双眼失明被迫停止旅行　　必喜要孩子们进入最近的时空1984年寻找一滴人类最激动最幸福时刻流下的眼泪来擦亮眼睛才能继续旅行返回1896年　　皮休和贝贝分别在1984年找到了中国射击运动员许海峰和海地马拉松运动员拉莫特几经周折贝贝从拉莫特身上取到了眼泪两人返回时空隧道时却遇到与必喜大战的阿瑞斯混乱中必喜的龙之如意被夺走身体变得虚弱并缩小　　贝贝用眼泪替必喜恢复了视力但只有找回如意才能穿越下一道世纪大门进入1896年因此必喜带着两个孩子开始寻找如意　　他们在不同的奥运年代都发现了如意的存在但收集到的却是一个一个小如意珠原来如意被阿瑞斯分散放置在运动员身上复制能量为自己所用在皮休和贝贝的努力下如意珠被一个一个收集起来最后还剩两个就可以组合成龙之如意了　　这时阿瑞斯却制造了一起陷阱将三人带去他的黑暗王国骷髅岛　　在福娃兄弟姐妹的帮助下贝贝在千钧一发的时刻醒来救出皮休逃离了骷髅岛　　两人又在其他福娃帮助下进入1988年找到最后两个如意珠并借机发现了骷髅岛的秘密只有奥运圣火才能突破通往骷髅岛的大门　　可黑暗小妖将通往奥运节点的道路严密封锁起来不让他们取得圣火　　皮休回忆起自己在东京奥运会上结识过的一个人说过他要偷圣火回家乡给父老乡亲看于是他带着贝贝去到了那个人的家乡鹿儿岛并在那里拿到了燃烧了20几年的圣火　　两人利用圣火突破进骷髅岛救出了必喜并拿回了所有的如意珠　　如意珠合并形成如意必喜也全然恢复了他们兴高采烈地去到19世纪大门前却发现即便有如意大门也打不开原来阿瑞斯眼见必喜逃脱如意也被拿回便强行封锁了世纪大门并根据皮休多嘴透露出的信息在1896年的希腊雅典寻找木盒　　在必喜的好朋友火儿姑娘的提醒下他们才得知打开大门的唯一方式是收集人类记忆信息只要找到足够的宽厚正义谦让才能诚信对应仁义礼智信五种信息便可以解除封印打开世纪大门　　于是三人再度进入时空中的奥运会进行寻找　　在1924年巴黎奥运会上取得了哈洛德的礼之信息　　在1932年洛杉矶奥运会上取得了刘长春的义之信息　　在1936年柏林奥运会上取得了欧文斯的仁之信息卢兹朗的义之信息还有击剑选手海琳娜的信之信息　　在1948年伦敦奥运会上取得了芬尼的智之信息　　在2004年雅典奥运会上取到了来自孟关良杨文军及瓦尔德内尔的信息　　其间阿瑞斯眼见事态一步步走向失败情急之下只好去求助居住在死亡之海的蛇发女美杜莎请她拿出黑暗号角让自己拥有召唤暗黑怪兽军团的力量　　因此当三人拿着足够的记忆信息前去打开世纪大门时遭到了暗黑怪兽军团的袭击双方纠缠打斗着进入了1896年最后贝贝用智慧击退了怪兽并利用雅典娜给的橄榄叶找到了埋藏木盒的位置　　不料刚挖出木盒阿瑞斯又将木盒抢去贝贝皮休必喜奋力追入骷髅岛必喜在骷髅岛大门处用自己的身体托起大门化为了一座石雕　　最后大战在骷髅岛展开顾拜旦送来的其他四个福娃也加入了战斗骷髅岛一片天昏地暗　　阿瑞斯为了打败福娃打开了木盒不料木盒中空空如也根本没有他所想象的巨大能量唯一飘落出来的只有一句话号召全世界的年轻人到赛场上去拼斗而不是去战场上厮杀　　这时雅典娜复活盾牌上的裂纹一一复原她将阿瑞斯变成一团泥土融化在了骷髅岛的大地上原本阴森恐怖的骷髅岛顿时生长出繁茂的鲜花与植物必喜石雕安详地屹立在此　　雅典娜要他们警惕阿瑞斯复活并告诉他们必喜并没有死只要让奥运会一直延续下去他就有复活的一天伤心的皮休决定留下来陪伴六哥直到他醒来　　而福娃们则返回2008年为了守护奥运会而努力去了